Tahun 1973 Farkes tergabung dalam Serikat Buruh Farmasi dan Kesehatan (SBFK) yang pada saat itu berafiiasi ke Serikat Pekerja Seluruh Indonesia (SPSI).

Tahun 1982, Serikat Buruh Farmasi dan Kesehatan (SBFK) bergabung dengan Serikat Buruh Kimia dan Pertambangan Umum.

Tahun 1995 Serikat Buruh Farmasi dan Kesehatan (SBFK) melepas sektor Kimia dan bergabung dengan Serikat Buruh sektor Rumah Sakit, dan SBFK berubah nama menjadi Federasi Serikat Pekerja Farmasi dan Kesehatan (FSP FARKES).

Tahun 1998 beberapa afiliasi memisahkan diri dari SPSI dan membentuk Konfederasi Serikat Pekerja Indonesia (KSPI).

Tanggal 6 Oktober 1998, FSP FARKES REFORMASI dibentuk dan berafiliasi ke KSPI.

FSP FARKES Reformasi juga berafiliasi ke organisasi serikat pekerja Internasional, yaitu ke Public Service International (PSI) dan ke IndustriALL.